MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 9258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010998	TGC	2	6	221	226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895318
2	NC_010998	GGAC	2	8	233	240	25 %	0 %	50 %	25 %	190895318
3	NC_010998	GT	3	6	259	264	0 %	50 %	50 %	0 %	190895318
4	NC_010998	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895318
5	NC_010998	CG	3	6	393	398	0 %	0 %	50 %	50 %	190895318
6	NC_010998	TGC	2	6	430	435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895318
7	NC_010998	CGG	2	6	444	449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
8	NC_010998	CCTG	2	8	465	472	0 %	25 %	25 %	50 %	190895318
9	NC_010998	CGA	2	6	572	577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895318
10	NC_010998	GAG	2	6	579	584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895318
11	NC_010998	CGCT	2	8	601	608	0 %	25 %	25 %	50 %	190895318
12	NC_010998	CTT	2	6	633	638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895318
13	NC_010998	ATG	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895318
14	NC_010998	CGA	3	9	746	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895318
15	NC_010998	TGC	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895318
16	NC_010998	GCC	2	6	815	820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895318
17	NC_010998	CAT	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895318
18	NC_010998	GGT	2	6	891	896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895318
19	NC_010998	GC	3	6	917	922	0 %	0 %	50 %	50 %	190895318
20	NC_010998	CGG	2	6	959	964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
21	NC_010998	GCG	2	6	986	991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
22	NC_010998	GCAC	2	8	1089	1096	25 %	0 %	25 %	50 %	190895318
23	NC_010998	GCC	2	6	1120	1125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895318
24	NC_010998	CAG	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895318
25	NC_010998	CGG	2	6	1183	1188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
26	NC_010998	GAT	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895318
27	NC_010998	CGC	2	6	1216	1221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895318
28	NC_010998	GCG	2	6	1222	1227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
29	NC_010998	ATC	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895318
30	NC_010998	AGAGCG	2	12	1485	1496	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190895319
31	NC_010998	ACG	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895319
32	NC_010998	GC	3	6	1629	1634	0 %	0 %	50 %	50 %	190895319
33	NC_010998	GAT	3	9	1666	1674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895319
34	NC_010998	CAT	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895319
35	NC_010998	TCG	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895319
36	NC_010998	TGG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895319
37	NC_010998	GGC	2	6	1762	1767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895319
38	NC_010998	GAA	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895319
39	NC_010998	GAA	3	9	1906	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895319
40	NC_010998	GCG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895319
41	NC_010998	CAC	2	6	1939	1944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895319
42	NC_010998	GCG	2	6	1953	1958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895319
43	NC_010998	CGA	2	6	1995	2000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895319
44	NC_010998	GCA	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895319
45	NC_010998	TCG	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895319
46	NC_010998	AGCG	2	8	2164	2171	25 %	0 %	50 %	25 %	190895320
47	NC_010998	GGC	2	6	2256	2261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
48	NC_010998	CCGG	2	8	2312	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	190895320
49	NC_010998	TCCG	2	8	2343	2350	0 %	25 %	25 %	50 %	190895320
50	NC_010998	ACG	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895320
51	NC_010998	GGC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
52	NC_010998	TCG	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895320
53	NC_010998	GC	3	6	2509	2514	0 %	0 %	50 %	50 %	190895320
54	NC_010998	GGCG	2	8	2556	2563	0 %	0 %	75 %	25 %	190895320
55	NC_010998	CGGAA	2	10	2565	2574	40 %	0 %	40 %	20 %	190895320
56	NC_010998	CGG	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
57	NC_010998	CGG	2	6	2648	2653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
58	NC_010998	CGG	2	6	2707	2712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
59	NC_010998	GCG	2	6	2713	2718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
60	NC_010998	GGC	2	6	2805	2810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
61	NC_010998	GGT	2	6	2819	2824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895320
62	NC_010998	GCG	2	6	2850	2855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
63	NC_010998	CGA	2	6	2900	2905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895320
64	NC_010998	CG	3	6	2958	2963	0 %	0 %	50 %	50 %	190895321
65	NC_010998	TCT	2	6	2967	2972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895321
66	NC_010998	GC	3	6	2991	2996	0 %	0 %	50 %	50 %	190895321
67	NC_010998	GGC	2	6	3049	3054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895321
68	NC_010998	AAGA	2	8	3063	3070	75 %	0 %	25 %	0 %	190895321
69	NC_010998	TCC	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895321
70	NC_010998	GAA	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895321
71	NC_010998	CTG	2	6	3139	3144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895321
72	NC_010998	CAG	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895321
73	NC_010998	GGC	2	6	3210	3215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895321
74	NC_010998	CGAT	2	8	3242	3249	25 %	25 %	25 %	25 %	190895321
75	NC_010998	AGC	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895321
76	NC_010998	GCC	2	6	3292	3297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895321
77	NC_010998	GCAC	2	8	3326	3333	25 %	0 %	25 %	50 %	190895321
78	NC_010998	TCC	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895321
79	NC_010998	GC	5	10	3381	3390	0 %	0 %	50 %	50 %	190895321
80	NC_010998	GCG	2	6	3404	3409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895321
81	NC_010998	TGAG	2	8	3450	3457	25 %	25 %	50 %	0 %	190895321
82	NC_010998	CGGCA	2	10	3486	3495	20 %	0 %	40 %	40 %	190895322
83	NC_010998	A	7	7	3495	3501	100 %	0 %	0 %	0 %	190895322
84	NC_010998	CGG	2	6	3508	3513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895322
85	NC_010998	CGC	2	6	3520	3525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895322
86	NC_010998	GAAA	2	8	3629	3636	75 %	0 %	25 %	0 %	190895322
87	NC_010998	CCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895322
88	NC_010998	GCTTC	2	10	3753	3762	0 %	40 %	20 %	40 %	190895322
89	NC_010998	TGA	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895322
90	NC_010998	TGA	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895322
91	NC_010998	CGA	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895322
92	NC_010998	GGCA	2	8	3997	4004	25 %	0 %	50 %	25 %	190895323
93	NC_010998	GCG	2	6	4025	4030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895323
94	NC_010998	CGAT	2	8	4056	4063	25 %	25 %	25 %	25 %	190895323
95	NC_010998	CG	3	6	4171	4176	0 %	0 %	50 %	50 %	190895323
96	NC_010998	TCGC	2	8	4206	4213	0 %	25 %	25 %	50 %	190895323
97	NC_010998	GTA	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895323
98	NC_010998	AGGC	2	8	4292	4299	25 %	0 %	50 %	25 %	190895323
99	NC_010998	GCC	3	9	4404	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
100	NC_010998	ATC	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895324
101	NC_010998	CAG	3	9	4427	4435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
102	NC_010998	CGG	2	6	4459	4464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895324
103	NC_010998	TCG	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895324
104	NC_010998	GCC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
105	NC_010998	CGA	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
106	NC_010998	GC	3	6	4710	4715	0 %	0 %	50 %	50 %	190895324
107	NC_010998	CTT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895324
108	NC_010998	TCG	2	6	4767	4772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895324
109	NC_010998	CG	3	6	4793	4798	0 %	0 %	50 %	50 %	190895324
110	NC_010998	ATG	2	6	4827	4832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895324
111	NC_010998	GGC	3	9	4865	4873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895324
112	NC_010998	CGGCGA	2	12	4894	4905	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190895324
113	NC_010998	CGC	2	6	4957	4962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
114	NC_010998	TCT	2	6	4975	4980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895324
115	NC_010998	CGAC	2	8	5038	5045	25 %	0 %	25 %	50 %	190895324
116	NC_010998	GCC	2	6	5048	5053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
117	NC_010998	CGA	2	6	5104	5109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
118	NC_010998	CGC	2	6	5116	5121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
119	NC_010998	GCC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
120	NC_010998	CAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
121	NC_010998	GCC	2	6	5216	5221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
122	NC_010998	CGA	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
123	NC_010998	GT	3	6	5287	5292	0 %	50 %	50 %	0 %	190895324
124	NC_010998	GCGCC	2	10	5349	5358	0 %	0 %	40 %	60 %	190895324
125	NC_010998	GC	3	6	5398	5403	0 %	0 %	50 %	50 %	190895324
126	NC_010998	GAT	2	6	5414	5419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895324
127	NC_010998	ACGGCG	2	12	5424	5435	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190895324
128	NC_010998	GAC	2	6	5483	5488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
129	NC_010998	ACG	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
130	NC_010998	CGA	2	6	5596	5601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
131	NC_010998	GCC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
132	NC_010998	TTG	2	6	5661	5666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895324
133	NC_010998	GCC	2	6	5672	5677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
134	NC_010998	CAGG	2	8	5707	5714	25 %	0 %	50 %	25 %	190895324
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264	NC_010998	GCG	3	9	11611	11619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895326
265	NC_010998	CGG	2	6	11632	11637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895326
266	NC_010998	CAA	2	6	11665	11670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895326
267	NC_010998	CGG	3	9	11677	11685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895326
268	NC_010998	TTG	2	6	11716	11721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895326
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272	NC_010998	GC	3	6	11871	11876	0 %	0 %	50 %	50 %	190895327
273	NC_010998	CGA	2	6	11889	11894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895327
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281	NC_010998	CTG	2	6	12085	12090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895327
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297	NC_010998	CTG	2	6	12550	12555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895327
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